El día que Taiju Oki, un adolescente fuerte pero algo palurdo, se decide por no declararle su amora Yuzuriha, sucede algo radical e inesperado: justo un segundo antes de la declaración, causas desconocidas llevan al total de la humanidad a convertirse instantáneamente en piedra. Después de 3.689 años y 158 días, durante los que ha luchado por no perder la consciencia y desaparecer, Taiju nalmente emerge de la piedra y vuelve a la normalidad. Aunque solo para descubrir que el resto de la humanidad jamas desperto de su sueño petreo. Luego se entera de que su amigo Senku, un genio absoluto de vocación científica y mentalidad mucho mas pragmática, también ha sobrevivido, y juntos encuentran una formula para volver a la vida a muchas de las estatuas que nose han partido en pedazos con el paso de los siglos. Llegados a este punto se marcan como objetivo reconstruir la civilización desde sus cimientos y tratar de alcanzar el mismo desarrollo tecnológico que había antes de la catastrofe de origen desconocido. Pero tienen que hacerlo de la forma mas acelerada posible ya que no quieren morirse en la edad de piedra. La
